Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms