Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms