Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms