Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms