Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms