Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf1P81269 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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