Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms