Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SbdsP70122 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms