Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms