Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PlnP61014 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PlnP61014 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PlnP61014 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PlnP61014 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms