Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf5P56477 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Irf5P56477 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Irf5P56477 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Irf5P56477 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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