Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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