Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Tmod1P49813 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tmod1P49813 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tmod1P49813 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tmod1P49813 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tmod1P49813 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmod1P49813 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmod1P49813 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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