Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms