Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TpoP35419 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TpoP35419 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TpoP35419 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TpoP35419 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TpoP35419 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TpoP35419 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TpoP35419 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms