Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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