Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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