Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Pou4f1P17208 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms