Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mtatp6P00848 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms