Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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DffaO54786 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffaO54786 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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DffaO54786 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffaO54786 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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DffaO54786 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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