Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms