Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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