Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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