Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms