Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms