Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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