Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms