Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3685J3QPP2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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