Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms