Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms