Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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