Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930544D05RikJ3QK56 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms