Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ScaperF8VQ70 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms