Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms