Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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