Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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