Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms