Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprbB2RU80 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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