Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf3B2RQG2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms