Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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