Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms