Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms