Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms