Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms