Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clip2Q9Z0H8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clip2Q9Z0H8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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