Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TapbpQ9R233 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TapbpQ9R233 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TapbpQ9R233 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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