Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms