Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ndrg3Q9QYF9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ndrg3Q9QYF9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms