Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms