Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Kcnip3Q9QXT8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kcnip3Q9QXT8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms